黄帝见蚩尤确实不好对付，就令应龙喷水。应龙张开巨口，江河般的水流从上至下喷射而出，蚩尤没有防备，被冲了个人仰马翻。他也急令风伯雨师掀起狂风暴雨向黄帝阵中打去，只见地面上洪水暴涨，波浪滔天，情况很紧急。这时，女魃上阵了，她施起神施，刹那间从她身上放射出滚滚的热浪，她走到哪里，哪里就风停雨消，烈日当头。风伯和雨师无计可施，慌忙败走了。黄帝率军追上前去，大杀一阵，蚩尤大败而逃。
蚩尤的头跟铜铸的一样硬，以铁石为饭，还能在空中飞行，在悬崖峭壁上如走平地，黄帝怎么也捉不住他。追到冀州中部时，黄帝灵感突现，命人把夔牛皮鼓使劲连擂九下，这一下，蚩尤顿时魂丧魄散，不能行走，被黄帝捉住了。黄帝命人给蚩尤戴上枷栲，把他杀了。害怕他死后还作怪，便把他的身和首埋在了两个地方。蚩尤死之后，他身上的枷栲才被取下来抛掷在荒山上，变成了一片枫树林，那每一片枫叶，都是蚩尤枷栲上的斑斑血迹。
黄帝打败蚩尤后，诸侯都尊奉他为天子，这就是轩辕黄帝的名字黄帝。轩辕黄帝带领百姓，开垦农田，定居神州，奠定了炎黄民族的根基。
刑天是巫族大巫，蚩尤起兵一统人族，却被黄帝铲平，因而身首异处，刑天一怒之下便手拿着利斧，杀到天庭中央的南天门外，指名要与天帝单挑独斗。最后刑天不敌，被天帝斩去头颅。而没了头的刑天并没有因此死去，而是重新站了起来，并把胸前的两个当作眼睛，把肚脐当作嘴巴左手握盾，右手拿斧。因为没了头颅，所以他只能永远的与看不见的敌人厮杀，永远的战斗。
当然，真实的历史则是这样，但后来蚩尤被十二祖巫救了回来，刑天的头颅也被找了回来。他们两个只能待在十二祖巫殿旁边，而九黎族则撤退到了蛮荒之地的祖地。至于那位黄帝吗？也不敢打过来，完全是找死的。
蚩尤的伤势好了之后。黄帝就再也不敢来蛮荒之地。如果不是十二祖巫约束蚩尤，蚩尤早就打上黄帝，跟黄帝再次决战了。至于刑天也被约束不能离开蛮荒之地。
后来那黄帝也离开了万神大陆，去往万神大陆开辟的其他位面。完全是怕了蚩尤，毕竟只要蚩尤在蛮荒之地一天。他就永远不可能踏入蛮荒之地一步。与其提心吊胆还不如，离开这个万神大陆。
九黎族也没有踏入神州一步，有十二祖巫殿庇护，神州的其他皇帝也不敢打到这里来。